На днях очередной раз столкнулся с тем, что Plugin Registration Tool последней версии SDK не работает, не возможно зарегистрировать Custom Workflow или плагин от имени админа.
Проблема решается использованием Plugin Registration Tool более ранней версии SDK (6.0.4).
В связи с чем, выложил у себя все версии SDK в разделе Ресурсы MS Dynamics CRM 2013.
